Ефективність госпрозрахунку і ступінь його впливу на поліпшення роботи підприємства в цілому залежить від встановлення чіткої системи внутрішньовиробничих госпрозрахункових взаємин.
Взаємовідносини структурних підрозділів підприємства будуються на основі функціональних обов'язків, встановлених кожному підрозділу їх внутрішньозаводських зобов'язань з виконання планових завдань, пов'язаних з випуском продукції відповідно до договорів, забезпеченням сировиною, матеріалами , напівфабрикатами, послугами в необхідному обсязі і заданої номенклатурі, раціональним використанням коштів.
Госпрозрахункові відносини основних і допоміжних цехів встановлюються в процесі здійснення внутрішньозаводський кооперації та обслуговування виробництва.
Взаємовідносини цехів з відділами та службами підприємства встановлюються в процесі планування технічної підготовки виробництва, розробки та впровадження орг-техзаходів, організації матеріально-технічного постачання.
Кожний внутрішньозаводський підрозділ зобов'язаний виконувати планові завдання, дотримуватися календарні графіки поставок за внутрішньозаводський кооперації та інші госпрозрахункові зобов'язання у встановлений термін і належної якості, невиконання яких негативно позначається на результатах госпрозрахункової діяльності інших ланок і підприємства в цілому.
Невиконання планових завдань і госпрозрахункових зобов'язань є порушенням планової, госпрозрахункової дисципліни і тягне за собою взаємну матеріальну відповідальність шляхом стягнення заподіяної шкоди з винних підрозділів.
Облік виконання всіх планових завдань і госпрозрахункових зобов'язань здійснюється в порядку і формах обліку та звітності, встановлених на підприємстві .
Матеріальна відповідальність внутрішньозаводських підрозділів за заподіяну ними шкоду досягається шляхом пред'явлення економічно обгрунтованих претензій.
Госпрозрахункові претензії обгрунтовуються первинними документами бухгалтерського та оперативного обліку (акти простою робочих, обладнання, наряди за простій, акти на шлюб, на неякісний і невчасний ремонт обладнання, графіки поставок деталей і вузлів по внутрішньозаводський кооперації, штрафи і санкції, сплачені підприємством іншим організаціям та інші первинні документи, плани, графіки).
До збитків, завданих одним підрозділом іншому, відносяться додаткові витрати по витраті матеріалів , енергії, палива, заробітної плати або втрати, що виникли з вини іншого підрозділу.
Підрозділи підприємства несуть матеріальну відповідальність за допущені ними помилки і прорахунки, які потягли за собою втрати.
Сума за претензіями встановлюється у розмірі фактично заподіяної шкоди.
Обов'язковою умовою при переробці штрафних санкцій за претензіями є їх економічне обгрунтування, узгодження з витратами конкретних цехів.
При наявності вини у невиконанні госпрозрахункових зобов'язань з боку як підрозділи-виконавця, так і підрозділи-споживача, розмір матеріальної відповідальності (сума штрафу збитків) визначається відповідно до ступенем відповідальності кожного з них.
Рішення про наявність останньої приймає арбітр, компетентний у цих питаннях.
Відшкодування збитків або стягнення штрафу не звільняє винні підрозділи від подальшого реального використання планових завдань, госпрозрахункових зобов'язань по відношенню до інших підрозділів.
На винні відділи (служби) підприємства покладається матеріальна відповідальність за сплачені штрафи стороннім організаціям шляхом накладення матеріальної відповідальності на начальників у встановленому порядку і депреміювання безпосередньо винних відповідно до рішення претензійної комісії.
За внутрішньозаводських претензіям матеріальна відповідальність відділів і служб реалізується шляхом прямого зниження розміру їх госпрозрахункової прибутку при наявності матеріального збитку.
Розмір зниження премії вирішує арбітр чи претензійна комісія окремо в кожному конкретному випадку.